En lo que respecta a las modificaciones introducidas al Reglamento interno se destaca que las decisiones de la Mesa Directiva pasaron a ser adoptadas por consenso y no más por mayoría, como establecía el texto.
Por otro lado, en lo referente a las decisiones en el plenario, las mayorías quedaron de la siguiente manera: a) Reforma del Reglamento: mayoría calificada; b) Dictámenes, proyectos de normas, anteproyectos de normas: mayoría especial; c) Informe sobre Derechos Humanos (PCPM, art.4, inciso 3): mayoría absoluta; d) Disposiciones: mayoría absoluta; e) Declaraciones y recomendaciones: mayoría simple.
El mandato de la Presidencia del Parlamento del MERCOSUR también pasará de 6 meses a 1 año, de forma rotativa entre los integrantes de la Mesa Directiva, ya que los parlamentarios entendieron que era necesario dar un mayor tiempo a los presidentes para consolidar la institución en esos primeros años de transición hacia las elecciones directas en todos los Estados Miembros.
La Mesa Directiva también decidió sobre la presidencia de las distintas Comisiones Permanentes del Parlamento del MERCOSUR. Se decidió que cada país tendrá 2 (dos) presidencias de comisiones y los nombres de los Presidentes deberán ser indicados en la próxima Sesión Plenaria. De esa forma, las Presidencias de las Comisiones quedo así distribuida:
• Asuntos Jurídicos e Institucionales (URUGUAY)
• Asuntos Económicos, Financieros, Comerciales, Fiscales y Monetarios (ARGENTINA)
• Asuntos Internacionales, Interregionales y de Planeamiento Estratégico (VENEZUELA)
• Educación, Cultura, Ciencia, Tecnología y Deporte (PARAGUAY)
• Trabajo, Políticas de Empleo, Seguridad Social y Economía Social (BRASIL)
• Desarrollo Regional Sustentable, Ordenamiento Territorial, Vivienda, Salud, Medio Ambiente y Turismo (BRASIL)
• Ciudadanía y Derechos Humanos (ARGENTINA)
• Asuntos Interiores, Seguridad y Defensa (VENEZUELA)
• Infraestructura, Transportes, Recursos Energéticos, Agricultura, Pecuaria y Pesca (PARAGUAY)
• Presupuesto y Asuntos Internos (URUGUAY)
Todas las modificaciones al Reglamento Interno deberán ser aprobadas en la próxima Sesión Plenaria, que se realizará el día 7 de Abril en la Sede del PARLASUR, en Montevideo, Uruguay. Para la aprobación es necesaria la mayoría calificada, o sea, la mayoría absoluta en cada Delegación.
El Parlamento del MERCOSUR es el órgano legislativo del Mercosur y cuenta con representación de los cinco países miembros del bloque, aunque por el momento sólo Paraguay los ha elegido de manera directa. Está integrado por 26 parlamentarios de Argentina, 37 de Brasil, 23 de Venezuela, 18 de Paraguay y 18 de Uruguay.